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资讯 | 我国科研团队在大豆基因研究上取得新进展

2023-10-09 09:10:25 8

10月6日,广西大学王海峰教授团队与东北农业大学陈庆山教授团队合作,成功发布了中国大豆品种“中黄13”(ZH13)的完整基因组“ZH13-T2T”,并首次绘制了该大豆品种的表观遗传修饰图谱。这一研究结果以The T2T Genome Assembly of Soybean Cultivar ZH13 and Its Epigenetic Landscapes(大豆栽培品种中黄13的端粒到端粒完整基因组及其表观遗传修饰图谱)为题发表于《分子植物》(Molecular Plant)。《分子植物》是Cell Press出版社旗下植物学领域最高层期刊之一。广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、农学院为第一署名单位。

研究人员整合了Nanopore(纳米孔)超长测序、PacBio HiFi(PacBio 高保真,PacBio是国外测序公司的名字)测序和Hi-C(高通量染色体构象捕获技术)技术,成功组装了近乎完整的ZH13-T2T基因组(图A),填补了ZH13v2基因组的空白区域,特别是着丝粒和端粒区域。作者补充了约26Mb的新序列,并校正了35个倒位和163个易位,其中大部分结构变异发生在着丝粒区域(图B),为进一步研究大豆的功能基因组提供了坚实的数据基础。

该研究不仅成功组装了中国大豆品种ZH13的T2T基因组,还绘制了首个完整的表观遗传修饰图谱,解析了大豆复杂区域(着丝粒与端粒)的表观修饰特征,这些工作将极大地促进了对大豆基因表达调控网络的研究以及育种工作。

广西大学王海峰教授和东北农业大学陈庆山教授为该论文的通讯作者,广西大学博士研究生张超、助理教授谢亮,博士研究生于航以及东北农业大学副教授王锦辉为论文的共同第一作者。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、广西自然科学基金等多个项目的资助。(来源:中国青年报)

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